در ممیزی مراقبتی مستندات تغییر یافته سیستم های مدیریت استاندارد بررسی و گزارش های ممیزی های داخلی و عملکرد آن باتوجه به روش های اجرایی استاندارد ارزیابی می شود. البته میزان سخت گیری در ممیزی مراقبتی همانند ممیزی اصلی جهت اخذ گواهینامه استاندارد به مرجعی که گواهینامه استاندارد را صادر کرده بستگی دارد برخی از مراجع اعمال بسیارسخت گیرانه در ممیزی مراقبتی انجام می دهند و تا رفع تمام عدم انطباق ها گواهینامه استاندارد را تمدید نمی کنند اما برخی مراجع سخت گیری کمتری دارند در زمان مواجهه با عدم انطباق های جزئی انعطاف نشان داده و به تذکر بسنده می کنند.
باید توجه داشت انجام ممیزی مراقبتی با تصمیم کارفرما انجام می شود، اگر ممیزی مراقبتی انجام نشود گواهینامه استاندارد اخذ شده از شرکت پس گرفته نمی شود ولی نام و مشخصات شرکت به سرعت از سایت مرجع صدور گواهینامه استاندارد خارج و درحقیقت گواهینامه استاندارد اخذ شده از نظر مرجع صادرکننده استاندارد فاقد اعتبار است و در صورت نیاز بایستی مراحل اخذ گواهینامه استاندارد را از ابتدا انجام دهند.درخصوص هزینه انجام ممیزی مراقبتی هزینه های متفاوتی اخذ می شود که این تفاوت در قیمت ها بستگی به مرجع صدور استاندارد دارد ولی معمولاً کمتر از هزینه اصلی گواهینامه استاندارد است.
